真空冷凍干燥機的制冷系統是其核心系統，它的穩定與否決定凍干制品的質量，所以，制冷系統穩定運行相當關鍵，那么我們要如何維護呢？
　　1.  只有具備專業知識的人員才能對制冷系統展開維護或維修。
　　2.  真空冷凍干燥機制冷系統電氣部件具有高電壓，因此，在制冷系統維護或維修時，首先應切斷電源。
　　3.  接通電源后，電源開關處于接通狀態，即使沒有操作設備，壓縮機也可能隨時啟動回收制冷劑。
　　4.  制冷系統高壓部分高溫達100℃以上，預防燙傷，制冷系統低壓部分低溫達-70℃以下，預防凍傷。
　　5.  真空冷凍干燥機制冷系統制冷劑對大氣產生污染，不可隨意排放。排放制冷劑時請從制冷系統高壓部分開始，并確保水冷凝器冷卻水處于流動狀態，預防水冷凍裂。
　　6.  制冷劑加注和排放時不要在密閉環境及明火中操作，避免窒息和中毒。
　　7.  制冷劑加注和排放穿戴好個人防護，小心操作，避免液態制冷劑濺入眼睛或皮膚。
　　8.  制冷系統帶壓狀態禁止對制冷系統施焊或拆卸部件。
　　9.  制冷系統冷凍機油處理請參照當地環保要求。
　　要想使真空冷凍干燥機制冷系統穩定運行需要做到，勤看壓力表、溫度表是否在范圍內運行，勤聽設備運行有無雜音，勤查設備有無跑冒滴漏，并及時做好設備保養工作。